Xét nghiệm vi khuẩn đường ruột đọc các vi sinh vật có trong mẫu phân, và một nghiên cứu vừa được công bố trên tạp chí Nature đã thay đổi cách các nhà khoa học hiểu về bản chất thực sự của những vi sinh vật đó. Một nhóm nghiên cứu do Đại học Vienna dẫn đầu đã chứng minh rằng một loài vi khuẩn đường ruột thường chứa nhiều quần thể khác biệt về mặt tiến hóa, mỗi quần thể thích nghi với các điều kiện khác nhau bên trong ruột. Một số quần thể trong số đó có liên quan đến lão hóa, bệnh viêm ruột, ung thư đại trực tràng và đái tháo đường type 2. Các nhà nghiên cứu cũng cho biết những quần thể có khả năng cạnh tranh cao có thể lây lan giữa người với người và trên nhiều châu lục chỉ trong vài thập kỷ. Trong bài viết này, bạn sẽ tìm hiểu những gì nghiên cứu đã báo cáo, tại sao sự khác biệt giữa loài và chủng lại quan trọng, và xét nghiệm phân có thể cho bạn biết gì một cách thực tế hiện nay.
Nghiên cứu mới cho thấy điều gì
Các nhà nghiên cứu đã phân tích hàng nghìn mẫu vi khuẩn phân lập từ đường ruột người, cùng với dữ liệu metagenomics — toàn bộ vật liệu di truyền của một cộng đồng vi sinh vật — từ những người ở nhiều quốc gia khác nhau và thuộc các nhóm tuổi, tình trạng sức khỏe khác nhau.
Họ sử dụng một phương pháp gọi là sinh thái học ngược (reverse ecology), phương pháp này suy luận cách một sinh vật thích nghi với môi trường của nó từ bộ gen thay vì từ các thí nghiệm trong phòng thí nghiệm. Tín hiệu họ tìm kiếm là một lần quét chọn lọc toàn bộ bộ gen (genome-wide selective sweep): một vi khuẩn có được một đột biến có lợi, cạnh tranh vượt trội so với các họ hàng gần của nó, và các thế hệ con cháu của nó chiếm ưu thế. Kết quả là một quần thể mà các thành viên của nó giống nhau một cách bất thường và tách biệt rõ ràng so với các quần thể lân cận. Nhiều loài vi khuẩn đường ruột quen thuộc hóa ra lại phân chia thành nhiều dòng như vậy.
Điều này có ý nghĩa gì với bạn
Hầu hết các báo cáo hệ vi sinh vật hiện có ngày nay đều xác định tên loài. Nghiên cứu này cho thấy rằng việc chỉ xác định tên loài có thể đơn giản là chưa đủ chính xác, bởi vì hai quần thể của cùng một loài có thể hoạt động rất khác nhau bên trong cơ thể. Đó là một lý do tại sao kết quả hệ vi sinh vật lại khó giải đọc đến vậy cho đến nay.
Tại sao chủng quan trọng hơn loài
Phân loại vi khuẩn theo loài là cách làm tiện lợi, nhưng cách này gộp chung những sinh vật sống trong các môi trường hoàn toàn khác nhau. Hệ quả thực tế là rất khó xác định vi khuẩn nào thực sự liên quan đến bệnh, vi khuẩn nào chỉ tình cờ hiện diện, và vi khuẩn nào có thể có tác dụng bảo vệ.
Theo tác giả chính Xiaoqian Annie Yu, khi tính đến sự thích nghi tiến hóa thay vì chỉ đếm số loài, chúng ta có thể xác định chính xác hơn nhiều các đơn vị có ý nghĩa sinh học trong hệ vi sinh vật. Trong cùng một loài, một số quần thể xuất hiện thường xuyên hơn trong một số bệnh nhất định — một quy luật sẽ biến mất nếu gộp tất cả lại với nhau.
Điều này có ý nghĩa thiết thực với bất kỳ ai từng thắc mắc kết quả xét nghiệm đường ruột thực sự có nghĩa gì. Đây cũng là logic tương tự đã được áp dụng trong các xét nghiệm khác: bài viết của chúng tôi giải thích tại sao xét nghiệm calprotectin trong phân đo mức độ viêm chứ không phải chẩn đoán bệnh, và một bài khác mô tả xét nghiệm cấy phân, vốn tìm kiếm các vi sinh vật cụ thể thay vì đánh giá sự cân bằng tổng thể.
Vi khuẩn đường ruột lây lan giữa người với người
Phát hiện thứ hai là điều thu hút nhiều sự chú ý nhất. Nhóm nghiên cứu tìm thấy bằng chứng cho thấy các quần thể vi khuẩn có khả năng cạnh tranh cao có thể lây lan nhanh chóng trên khoảng cách lớn, trong một số trường hợp mở rộng ra khắp các châu lục chỉ trong vài thập kỷ. Cho đến nay, quy luật này chủ yếu được ghi nhận ở các mầm bệnh, chứ không phải ở những vi khuẩn đường ruột thông thường.
Trưởng nhóm nghiên cứu Martin F. Polz kết luận rằng vi khuẩn đường ruột năng động hơn những gì người ta từng nghĩ, và các chủng thích nghi tốt có thể lây lan ra quốc tế và định cư trong các môi trường mới. Hệ quả thực tế là chế độ ăn uống, thuốc men và lối sống có thể không phải là những yếu tố duy nhất định hình hệ vi sinh vật của bạn. Sự lây truyền giữa người với người cũng có thể đóng vai trò quan trọng.
Điều đó không có nghĩa là hệ vi sinh vật có thể lây lan như một bệnh dạ dày thông thường. Không ai trong nghiên cứu này mắc bệnh từ người cùng nhà. Điều mà dữ liệu gợi ý diễn ra chậm hơn và âm thầm hơn: theo năm tháng, các phiên bản cụ thể của những vi khuẩn phổ biến mà bạn mang trong người có thể phần nào phản ánh những người và môi trường xung quanh bạn.
Xét nghiệm phân có thể và không thể cho bạn biết điều gì hiện nay
Không có điều nào trong số này hiện có sẵn tại phòng khám. Khoảng cách giữa những gì nghiên cứu có thể đo lường và những gì phòng xét nghiệm có thể xác nhận là điều quan trọng nhất cần ghi nhớ trước khi đặt xét nghiệm bất kỳ. Cleveland Clinic nêu rõ rằng các nhà cung cấp dịch vụ chăm sóc sức khỏe lâm sàng thường không sử dụng hoặc khuyến nghị các bộ xét nghiệm hệ vi sinh vật đường ruột dành cho người tiêu dùng, vì chúng ta vẫn chưa hiểu đủ về cách hệ vi sinh vật đường ruột ảnh hưởng đến sức khỏe để những báo cáo như vậy có giá trị thực tiễn.
| Câu hỏi bạn có thể có | Những gì xét nghiệm hiện nay có thể cho biết |
|---|---|
| Tôi có bị nhiễm trùng hoặc ký sinh trùng không? | Có. Cấy phân và xét nghiệm ký sinh trùng tìm kiếm các vi sinh vật cụ thể và được sử dụng trong chăm sóc thường quy. |
| Ruột của tôi có bị viêm không? | Phần lớn là có. Calprotectin trong phân phản ánh tình trạng viêm ở ruột và giúp phân biệt bệnh viêm ruột với hội chứng ruột kích thích. |
| Có máu ẩn trong phân của tôi không? | Có. Xét nghiệm miễn dịch phân (FIT) phát hiện máu mà bạn không thể nhìn thấy và là nền tảng của các chương trình tầm soát ung thư đại trực tràng. |
| Hệ vi sinh vật đường ruột của tôi có cân bằng không? | Chưa có câu trả lời thống nhất. Hiện không có ngưỡng được xác nhận cho một hệ vi sinh vật đường ruột khỏe mạnh, và các báo cáo thương mại không được sử dụng trong chăm sóc lâm sàng thường quy. |
| Vi khuẩn của tôi có nghĩa là tôi sẽ mắc bệnh không? | Không. Các mối liên hệ ở cấp độ chủng là kết quả nghiên cứu trên nhóm dân số, không phải dự đoán cho một cá nhân cụ thể. |
Có một lưu ý nữa đáng biết trước khi bạn trả tiền cho một bộ xét nghiệm: kết quả cũng lưu lại ký ức lâu dài về tiền sử bệnh của bạn. Chúng tôi đề cập đến điều đó trong một bài viết riêng về ảnh hưởng của các thuốc đã dùng trước đây đến kết quả xét nghiệm hệ vi sinh vật đường ruột.
Những tiến bộ khoa học mới nhất
Nghiên cứu tại Vienna nằm trong một xu hướng chuyển dịch rộng lớn hơn. Ba nghiên cứu gần đây cho thấy tư duy ở cấp độ chủng vi khuẩn đã mang lại những gì, và giới hạn của nó ở đâu.
Một phân tích tổng hợp trên tạp chí Nature Medicine đã tập hợp 3.741 mẫu metagenome phân từ 18 nhóm người mắc ung thư đại trực tràng, u tuyến hoặc không có bệnh. Chỉ sử dụng metagenomics đường ruột, các tác giả đã cải thiện độ chính xác trong dự đoán ung thư đại trực tràng và xác định được các dấu hiệu đặc trưng theo chủng trong hai loại vi khuẩn đường ruột phổ biến — nghĩa là các nhóm nhỏ trong cùng một loài thông thường có liên quan đến bệnh ở giai đoạn muộn hơn. Điều này có nghĩa gì với bạn: hệ vi sinh vật đường ruột đang được đánh giá nghiêm túc như một mục tiêu tầm soát, nhưng đây là độ chính xác ở cấp độ dân số, không phải một xét nghiệm tại nhà.
Một phân tích chéo nhóm thứ hai đã khảo sát 8.117 metagenome phân từ mười nhóm người mắc đái tháo đường type 2, tiền đái tháo đường hoặc đường huyết bình thường tại Hoa Kỳ, châu Âu, Israel và Trung Quốc. Mười chín loài được liên kết với đái tháo đường type 2, và — gần với phát hiện ở Vienna — các tác giả xác định được sự đa dạng trong cùng một loài ở các chủng của 27 loài, điều này giúp giải thích tại sao nguy cơ lại khác nhau giữa người này và người khác. Điều này có nghĩa gì với bạn: hai người có thể mang cùng một loài vi khuẩn nhưng vẫn mang các phiên bản khác nhau của nó — đây là một trong những lý do khiến các nghiên cứu về hệ vi sinh vật trước đây thường cho kết quả mâu thuẫn nhau.
Một tổng quan năm 2025 về các dấu ấn sinh học hệ vi sinh vật trong bệnh viêm ruột, ung thư đại trực tràng và bệnh celiac đưa ra kết luận thận trọng: giải trình tự gen đã phát hiện cả những thay đổi toàn cục lẫn các dấu ấn sinh học tiềm năng, nhưng cần kết hợp nhiều loại dữ liệu khác nhau trước khi có thể dựa vào chúng để chẩn đoán hoặc điều trị. Điều này có nghĩa gì với bạn: đây là những hướng nghiên cứu đầy hứa hẹn, chứ chưa phải công cụ lâm sàng đã được xác lập.
Tất cả những điều này vẫn còn ở giai đoạn đầu. Không có điều nào trong số đó thay đổi những gì một phòng xét nghiệm sẽ báo cáo cho bạn trong năm nay.
Khi nào nên gặp bác sĩ
Các triệu chứng vẫn là điều nên thúc đẩy bạn đi khám, chứ không phải sự tò mò về vi khuẩn trong cơ thể. Hãy nói chuyện với chuyên gia y tế nếu bạn bị tiêu chảy kéo dài hơn hai tuần, có máu trong phân, sụt cân không rõ nguyên nhân, đau bụng dai dẳng, hoặc sốt kèm theo các triệu chứng tiêu hóa. Những ai thuộc nhóm tuổi được khuyến cáo tầm soát quốc gia cũng nên thực hiện tầm soát ung thư đại trực tràng khi được mời, bất kể kết quả xét nghiệm hệ vi sinh vật nói gì.
Nếu bạn đã có kết quả trong tay và chưa chắc chắn về ý nghĩa của nó, bài viết của chúng tôi đề cập đến các xét nghiệm phân thực sự hữu ích trong trường hợp tiêu chảy kéo dài, và một hướng dẫn khác giải thích triệu chứng và tầm soát ung thư đại trực tràng.
Bảng thuật ngữ
| Thuật ngữ | Định nghĩa |
|---|---|
| Hệ vi sinh vật (Microbiome) | Toàn bộ cộng đồng vi khuẩn, virus, nấm và các vi sinh vật khác sống ở một vị trí nhất định, chẳng hạn như đường ruột. |
| Metagenomics (Giải trình tự metagenome) | Đọc vật liệu di truyền của toàn bộ cộng đồng vi sinh vật cùng một lúc, thay vì nuôi cấy từng sinh vật riêng lẻ. |
| Loài (Species) | Cấp độ thông thường để đặt tên và báo cáo vi khuẩn. Tuy nhiên, cách phân loại này có thể che khuất những khác biệt có ý nghĩa bên trong cùng một nhóm. |
| Chủng (Strain) | Một phân nhóm nhỏ hơn trong cùng một loài. Hai chủng có thể cùng tên nhưng hoạt động khác nhau trong cơ thể. |
| Quét chọn lọc (Selective sweep) | Một đột biến có lợi lan rộng trong quần thể thành công đến mức các thế hệ con cháu của nó thay thế hoàn toàn các họ hàng gần. |
| Sinh thái học ngược (Reverse ecology) | Tìm hiểu cách một sinh vật thích nghi với môi trường sống của nó bằng cách nghiên cứu bộ gen thay vì quan sát trực tiếp. |
| Dấu ấn sinh học | Một tín hiệu sinh học có thể đo lường được, dùng để phát hiện một tình trạng bệnh lý, ước tính nguy cơ hoặc theo dõi sự tiến triển của nó. |
| Loạn khuẩn đường ruột (Dysbiosis) | Hệ vi sinh vật đường ruột mất cân bằng. Hiện chưa có ngưỡng số liệu thống nhất nào để xác định tình trạng này. |
| Calprotectin trong phân | Một loại protein được đo trong phân, tăng cao khi niêm mạc ruột bị viêm. |
| Xét nghiệm miễn dịch phân (FIT) | Xét nghiệm phân sử dụng kháng thể để phát hiện lượng nhỏ máu không nhìn thấy bằng mắt thường. |
Câu hỏi thường gặp
Bạn có thể lây vi khuẩn đường ruột từ người khác không?
Không theo cách bạn bị lây cảm lạnh. Nghiên cứu trên tạp chí Nature phát hiện rằng các quần thể vi khuẩn có thể lây lan giữa người với người và qua các vùng địa lý trong nhiều năm hoặc nhiều thập kỷ — đây là một quá trình sinh thái chậm chứ không phải là nhiễm trùng. Việc sống chung, ăn uống cùng nhau và chia sẻ môi trường sống có thể góp phần vào điều này. Điều đó không có nghĩa là sống chung với ai đó sẽ khiến bạn có cùng nguy cơ mắc bệnh như họ, và nghiên cứu cũng không kiểm tra câu hỏi đó.
Tôi có nên mua xét nghiệm hệ vi sinh vật đường ruột thương mại không?
Hầu hết các bác sĩ lâm sàng khuyên không nên phụ thuộc vào loại xét nghiệm này. Hiện tại chưa có định nghĩa thống nhất về hệ vi sinh vật đường ruột khỏe mạnh hay không khỏe mạnh, vì vậy điểm số được gán nhãn "tốt" hay "kém" không có ý nghĩa đã được kiểm chứng. Nếu bạn có các triệu chứng tiêu hóa, các xét nghiệm mà bác sĩ có thể chỉ định sẽ hữu ích hơn vì mỗi xét nghiệm trả lời một câu hỏi cụ thể.
Bác sĩ thường chỉ định những xét nghiệm phân nào?
Các xét nghiệm phổ biến bao gồm cấy phân để phát hiện nhiễm khuẩn, soi tìm trứng và ký sinh trùng, calprotectin trong phân để đánh giá tình trạng viêm ruột, và xét nghiệm miễn dịch phân (FIT) dùng trong tầm soát ung thư đại trực tràng. Đo lượng mỡ trong phân có thể được thêm vào khi nghi ngờ kém hấp thu.
Xét nghiệm ở cấp độ chủng vi khuẩn có sớm được áp dụng tại các phòng khám không?
Chưa phải trong tương lai gần. Các nhóm nghiên cứu đã có thể phân tích chủng vi khuẩn trong các bộ dữ liệu lớn, nhưng để chuyển điều đó thành một xét nghiệm được kiểm chứng với ngưỡng rõ ràng, kết quả có thể tái lập và lợi ích được chứng minh cần nhiều năm nữa. Chính các tác giả mô tả các dấu ấn sinh học tốt hơn là khả năng trong tương lai chứ không phải hiện tại.
Chế độ ăn có thể thay đổi các chủng vi khuẩn trong đường ruột của tôi không?
Chế độ ăn rõ ràng ảnh hưởng đến thành phần tổng thể của hệ vi sinh vật đường ruột, và chế độ ăn đa dạng giàu chất xơ giúp hỗ trợ sự đa dạng vi sinh vật. Tuy nhiên, liệu nó có thể thay thế một chủng của một loài bằng chủng khác hay không thì còn chưa được chứng minh rõ ràng. Điều hợp lý cần ghi nhớ là các khuyến nghị dinh dưỡng chung vẫn có giá trị, trong khi việc điều chỉnh chính xác từng chủng vi khuẩn thông qua thực phẩm hiện chưa thực hiện được.
Kết quả xét nghiệm phân của tôi có bất thường. Bây giờ phải làm gì?
Kết quả bất thường là điểm khởi đầu, không phải kết luận. Điều quan trọng là chỉ số nào bất thường, bất thường bao nhiêu, và đi kèm với những triệu chứng gì. Hãy mang kết quả đến gặp bác sĩ đã chỉ định xét nghiệm để được đánh giá trong bối cảnh cụ thể và quyết định các bước theo dõi tiếp theo.
Nguồn tham khảo
- Yu XA, Strachan CR, Herbold CW, et al. — Genome-wide sweeps create ecological units in the human gut microbiome — Nature, 2026 — nature.com
- University of Vienna — Evolutionary processes shape bacterial populations in the human gut — Press release, 2026 — univie.ac.at
- Piccinno G, et al. — Pooled analysis of 3,741 stool metagenomes from 18 cohorts for cross-stage and strain-level reproducible microbial biomarkers of colorectal cancer — Nature Medicine, 2025 — consensus.app
- Mei Z, et al. — Strain-Specific Gut Microbial Signatures in Type 2 Diabetes Revealed by a Cross-Cohort Analysis of 8,117 Metagenomes — Nature Medicine, 2024 — consensus.app
- San-Martin MI, et al. — Microbiome Markers in Gastrointestinal Disorders: Inflammatory Bowel Disease, Colorectal Cancer, and Celiac Disease — International Journal of Molecular Sciences, 2025 — consensus.app
- Cleveland Clinic — Hệ vi sinh vật đường ruột: tổng quan, chức năng và xét nghiệm — Thư viện sức khỏe — my.clevelandclinic.org
- Viện Quốc gia về Bệnh Tiểu đường, Tiêu hóa và Thận (NIH) — Vi sinh vật học đường tiêu hóa và bệnh truyền nhiễm — niddk.nih.gov
- Hiệp hội Ung thư Hoa Kỳ — Các xét nghiệm tầm soát ung thư đại trực tràng — cancer.org
Đọc thêm
- Xét nghiệm trứng và ký sinh trùng: cách thực hiện và ý nghĩa kết quả
- Xét nghiệm phân tại nhà giúp giảm 43% tử vong do ung thư đại tràng
- Độ đặc của phân: thang Bristol và thế nào là bình thường
- Phân nhiều mỡ: nguyên nhân, xét nghiệm và ý nghĩa của steatorrhea
- Xét nghiệm phân tìm Cyclospora: tại sao các xét nghiệm thông thường bỏ sót
Hiểu kết quả xét nghiệm của bạn với AI DiagMe
Nghiên cứu về các chủng vi khuẩn đang tiến triển rất nhanh, nhưng các xét nghiệm bạn thực sự nhận được vẫn là những xét nghiệm kinh điển: cấy phân, calprotectin trong phân, xét nghiệm ký sinh trùng và công thức máu đi kèm. Những kết quả đó chứa đầy con số và chữ viết tắt mà hiếm khi có lời giải thích. AI DiagMe đọc kết quả xét nghiệm máu, nước tiểu và phân của bạn, rồi giải thích bằng ngôn ngữ đơn giản từng chỉ số có nghĩa gì và chỉ số nào cần chú ý. Công cụ này giúp bạn hiểu kết quả và chuẩn bị câu hỏi cho bác sĩ; nó không đưa ra chẩn đoán và không thay thế bác sĩ của bạn.
Nhận kết quả giải thích chỉ trong vài phút
